É o neto do Sandaime Hokage (terceiro Hokage), tratado com respeito e mimado por todos apenas por ser neto do Hokage, nunca sendo chamando pelo nome. Por causa disso, ele decidiu ser Hokage para ser reconhecido por todos. Sua primeira ação foi ir atrás de Uzumaki Naruto, um jovem ninja, recente genin, e pedir que ele ensinasse para ele a técnica que derrubou seu avô, o Oiroke no Jutsu (conhecido como Sexy no Jutsu), uma técnica onde a pessoa usa Henge no Jutsu (transformação), virando uma mulher nua. Konohamaru é sobrinho do Asuma, um forte e respeitado jounin.

Konohamaru, decidido, segue Naruto, apesar de suas técnicas para se esconder serem facilmente detectadas. Naruto ensina o Oiroke no Jutsu para Konohamaru, que usa em seu tutor, Ebisu. Ebisu não se impressiona, então Naruto usa o Haaremu no Jutsu, onde ele usa Kage Bunshin no Jutsu, criando vários clones, e cada um deles usa Oiroke no Jutsu, aparecendo um monte de mulher nua, o que nocauteia Ebisu. Konohamaru aprende que para ser Hokage não existem caminhos fáceis, e marca Naruto como seu rival, usando um óculos igual ao que Naruto usava antes de virar ninja.

Mais tarde ele cria o Esquadrão Konohamaru, com seus amigos Moegi e Udon (que usam o mesmo óculos que ele), onde Naruto é o líder. Ele melhora suas técnicas pervertidas mesmo depois de virar ninja. O jounin de seu trio de Genins é Ebisu, junto com Moegi e Udon.